TortoiseMerge tem uma porção de diferentes utilidades:
Visualizando as diferenças entre dois arquivos e unificando as alterações em um único, ou removendo alterações indesejadas.
Editando conflitos entre alterações locais e alterações no repositório do Subversion vindas de uma atualização.
Aplicando arquivos de patch e revisando-os.
Neste modo você está comparando dois arquivos. O arquivo no lado esquerdo é considerado o arquivo original (algumas vezes referenciado como Deles, e o arquivo do lado direito é o arquivo modificado (algumas vezes referenciado como Meu).
Vcê pode fazer apenas simples alterações na linha-base no arquivo do painel direito o qual inclui:
Revertendo linhas alteradas para o mostrado no painel esquerdo
Usando uma combinação de ambos os blocos, ou Deles antes Meu ou Meu antes Deles.
Você pode também editar o arquivo no painel direito como se você estivesse em um editor de texto. Assim as linhas são marcadas usando o ícone de um lápis. Por favor note que se você quer fazer qualquer alteração de linha/bloco-base descrita abaixo, é melhor estas alterações primeiro já que uma vez que começou a editar o arquivo se torna impossível para o TortoiseMerge rastrear o relacionamento com o arquivo original.