Väčšina možností je samozrejmá, je však potrebné objasniť niekoľko bodov.
Zálohovať pôvodný súbor premenuje pôvodný súbor v pracovnej kópii nanazov_suboru.bak
pred uložením upravenej verzie.
Keď je nastavené Predvolené kódovanie UTF-8, súbory ANSI sa načítajú ako kódované v UTF-8 a po úpravách sa tak aj uložia.
Maximálna dĺžka riadka pre vnútroriadkové odlišnosti TortoiseMerge môže byť spomalený, pri zobrazení vnútroriadkových odlišností pre veľmi dlhé riadky. Z tohto dôvodu sa iba riadky, ktoré sú kratšie ako 3000 znakov, zobrazujú s vloženými rozdielmi. Túto hodnotu môžete zmeniť tu.
Ignorovať konce riadkov skryje zmeny, ktoré sú spôsobené výhradne rozdielom v štýle konca riadku.
Ignorovať zmeny veľkých a malých písmen skryje zmeny, ktoré sú spôsobené iba zmenami veľkosti textu. To môže byť užitočné pri aplikáciách, ako je Visual Basic, ktoré bez varovania mení veľkosť premenných.
Toto dialógové okno umožňuje zvoliť kódovanie farby pozadia použité na zvýraznenie rôznych zmien riadkov.